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单元测验01
1、【单选题】以下哪个是今天“生物信息学”的正确英语拼写？
A、biocomp
B、bioinformatics
C、bioinformatique
D、bio-informatics
E、biocompute
2、【单选题】以下哪位科学家获得了两次诺贝尔奖？
A、摩尔根（Thomas H. Morgen ）
B、沃森（James Waston）
C、桑格（Frederick Sanger）
D、克里克（Francis Crick）
E、霍利（Robert W. Holley）
3、【单选题】被称为“DNA之父”的是哪位科学家？
A、桑格（Frederick Sanger）
B、沃森（James Waston）
C、摩尔根（Thomas H. Morgen ）
D、克里克（Francis Crick ）
E、查加夫（Erwin Chargaff）
4、【单选题】被称为“计算机之父，人工智能之父”的是哪位科学家？
A、图灵（Alan Mathison Turing）
B、帕斯卡（Blaise Pascal）
C、莱布尼兹（Gottfried W Leibniz）
D、桑格（Frederick Sanger）
E、沃森（James Waston）
5、【单选题】被称为“现代实验生物学奠基人”的是哪位科学家？
A、摩尔根（Thomas H. Morgen ）
B、沃森（James Waston）
C、桑格（Frederick Sanger）
D、孟德尔（Gregor J. Mendel）
E、达尔文（Charles Darwin）
6、【单选题】被称为“遗传学的奠基人，现代遗传学之父”的是哪位科学家？
A、孟德尔（Gregor J. Mendel）
B、摩尔根（Thomas H. Morgen ）
C、沃森（James Waston）
D、查加夫（Erwin Chargaff）
E、米歇尔（Friedrich Miescher）
7、【单选题】谁是第一个提出“计算机”这个概念的人？
A、图灵（Alan Mathison Turing）
B、帕斯卡（Blaise Pascal）
C、莱布尼兹（Gottfried W Leibniz）
D、莫尔斯（S．F．B．Morse）
E、盖茨（Bill Gates）
8、【多选题】DNA双螺旋结构的解析与下列哪些人有关？
A、沃森（James Waston）
B、克里克（Francis Crick）
C、威尔金斯（Maurice Wilkins）
D、弗兰克林（Rosalind Franklin）
E、桑格（Frederick Sanger）
F、查加夫（Erwin Chargaff）
G、米歇尔（Friedrich Miescher）
H、约翰森（W. L. Johannsen）
单元测验02
1、【单选题】FASTA序列格式以哪个符号开头？
A、>
B、<
C、
D、
E、*
2、【单选题】从GenBank的哪一项注释中可以找到关于编码蛋白的信息？
A、SOURCE
B、RBS
C、CDS
D、ORIGIN
3、【单选题】以下关于GenBank的描述，哪个是正确的？
A、GenBank里的一条数据库记录对应一个完整的基因。
B、GenBank里的一条数据库记录可能只包含某个基因的一部分。
C、真核生物的基因经常是分段存储在多条GenBank数据库记录里。
D、真核生物的基因都是整个存储在GenBank的一条数据库记录里。
E、原核生物的基因都是分片段存储在多条GenBank数据库记录里。
F、真核生物的基因以外显子为单位，一条数据库记录存储一个外显子。
4、【单选题】以下哪个是NCBI下属的数据库？
A、GenBank
B、RefSeq
C、Gene
D、dbEST
E、Ensemble
F、HMP
G、ncRNA
H、Uniprot
5、【单选题】关于HMP的描述，以下哪个是正确的？
A、HMP是人类微生物组学计划
B、HMP目前已包括人类所有器官的微生物宏基因组样本数据
C、HMP由J. Craig Venter Institute独立完成
D、HMP是人类基因组计划
6、【单选题】以下关于PubMed的描述错误的是
A、任何生命科学领域的论文都可以从PubMed下载全文
B、PublMed是生物医学文献数据库
C、PubMed提供文章摘要和全文链接
D、1965年以前的文献没有被收录到PubMed里
7、【多选题】以下哪些数据库是核酸数据库？
A、GenBank
B、EMBL-ENA
C、DDBJ
D、Swissprot
E、TrEMBL
F、Uniprot
G、PDB
H、SCOP
I、CATH
J、NCBI-Gene
8、【多选题】以下关系式正确的是？
A、1G=1,000,000K
B、1T=1,000G
C、1T=1,000,000,000K
D、1T=1,000,000M
E、1G=1,000M
F、1G=1,000,000M
G、1G=1,000T
H、1T=1,000,000K
I、1M=1,000T
J、1T=1,000,000,000,000K
9、【判断题】GenBank数据库中的检索号（Accession）和基因座名（Locus）指的都是一条序列在数据库中的编号，他们永远都是相同的。
A、正确
B、错误
10、【判断题】当一个序列发生了改变，它的GenBank检索号（Accession）不变，但会被赋予一个新的GI号。
A、正确
B、错误
11、【判断题】对于GenBank的一条数据库记录，只要版本号（Version）增加，必然会产生一个新的GI号。
A、正确
B、错误
12、【判断题】GenBank里的一个序列因发生变化而被赋予新的GI号时，检索号（Accession）和版本号（Version）都不发生改变。
A、正确
B、错误
单元作业01
单元测验03
1、【单选题】以下关于Swiss-Prot数据库和TrEMBL数据库的描述错误的是：
A、Swiss-Port和TrEMBL同属于UniProtKB数据库
B、Swiss-Port是手动完成的注释，TrEMBL是自动完成的注释
C、Swiss-Prot包含的序列少，TrEMBL包含的序列多
D、TrEMBL数据量大，其中也包含Swiss-Prot里的序列
E、Swiss-Port是自动完成的注释，TrEMBL是手动完成的注释
F、TrEMBL数据量大，但并不包含Swiss-Prot里的序列
2、【单选题】以下哪个生物数据库提供信号传导通路信息？
A、Swiss-Prot
B、Pfam
C、DDBJ
D、PDB
E、KEGG
F、OMIM
G、GenBank
H、KEGG Pathway
3、【单选题】以下不是非冗余的蛋白质/核酸数据库的是：
A、RefSeq
B、UniProtKB TrEMBL
C、UniProtKB Swiss-Prot
D、UniRef
4、【单选题】全世界唯一存储生物大分子3D结构的数据库是：
A、UniProtKB
B、PDB
C、KEGG
D、OMIM
E、Pfam
F、CATH
G、Ensemble
H、DDBJ
5、【单选题】PDB文件是如何存储蛋白质3D结构的？
A、通过存储GIF动画
B、通过存储氨基酸序列
C、通过存储全息影像
D、通过存储蛋白质中每个原子的3D坐标
6、【单选题】以下哪种方法解析的蛋白质结构不可以提交到PDB数据库？
A、X射线衍射法
B、核磁共振法
C、冷冻电子显微镜技术
D、计算方法预测的结构模型
7、【单选题】以下哪些是蛋白质数据库？
A、Swiss-Prot
B、TrEMBL
C、PIR
D、DDBJ
E、GenBank
F、Ensemble
G、CATH
H、SCOP2
I、FlyBase
J、PDB
8、【多选题】下列关于生物数据库描述正确的是：
A、NCBI-GenBank、EMBL-ENA和DDBJ这三个数据库的数据通过“国际核酸序列数据库 联盟（INSDC）实时共享
B、PIR、Swiss-Prot、TrEMBL、PDB均属于蛋白质序列数据库
C、Swiss-Prot和TrEMBL同属于UniProtKB，他们的区别是，前者是手动完成的注释， 后者是自动完成的注释
D、PDB、CATH、Ensemble这三个数据库都是蛋白质数据库
E、Swiss-Prot和TrEMBL同属于UniProtKB，他们的区别是，前者是自动完成的注释， 后者是手动-完成的注释
F、PIR、Swiss-Prott、TrEMBL均属于蛋白质序列数据库
9、【多选题】以下哪些是关于蛋白质结构分类的数据库？
A、CATH
B、SCOP2
C、SCOP
D、PDB
E、Uniprot
F、PIR
G、Ensemble
H、KEGG
10、【多选题】以下关于PDB数据库描述正确的是：
A、PDB数据库是一级蛋白质数据库
B、PDB数据库存储大分子的3D结构
C、PDB数据库里既包含蛋白质的3D结构，也包含核酸的3D结构，以及二者的复合体结构
D、PDB数据库里只包含实验方法解析的大分子3D结构
E、PDB数据库是二级蛋白质数据库
F、PDB数据库只储存蛋白质分子的3D结构
G、PDB数据库里既包含实验方法解析的大分子3D结构，也包含计算机预测结构模型
H、X射线衍射法解析的蛋白质3D结构不能提交到PDB数据库
单元测验04
1、【单选题】以下关于转换和颠换描述错误的是？
A、A变T是颠换
B、A变G是转换
C、G变C是颠换
D、G变T是转换
2、【单选题】假设两个蛋白质序列的相似度在20%左右，那么应该采用的PAM矩阵是？
A、PAM60
B、PAM80
C、PAM120
D、PAM250
3、【单选题】假设你有两条亲缘关系很近的蛋白质序列。为了更好的比较它们，最好使用下列哪个BLOSUM或PAM矩阵？
A、BLOSUM45或PAM250
B、BLOSUM45或PAM10
C、BLOSUM80或PAM25
D、BLOSUM10或PAM25
4、【单选题】以下矩阵不属于蛋白质序列比对的替换积分矩阵的是?
A、等价矩阵
B、遗传密码矩阵（GCM）
C、转换-颠换矩阵
D、PAM矩阵
E、BLOSUM
5、【单选题】根据下面的全局比对结果，计算出这两条序列的一致度。<img src="http://edu-image.nosdn.127.net/563C4EDC6A503E9F22529937E50FF653.png?imageView
A、40%
B、50%
C、60%
D、70%
6、【单选题】根据下面的全局比对结果，计算出这两条序列的相似度。（是否相似参考下面的BLOSUME62替换记分矩阵）<img src="http://edu-image.nosdn.127.net/563C4EDC6A503E9F22529937E50FF653.png?imageViewBLOSUME62替换记分矩阵<img width="562" height="307" style="width: 506px; height: 278px;" src="http://edu-image.nosdn.127.net/F61892195045B1900F8ADDA8CC5EC891.png?imageView&thumbnail=890x0&quality=100" />
A、40%
B、50%
C、60%
D、70%
单元作业02
单元测验05
1、【单选题】BLAST是什么？
A、火箭发射系统
B、蛋白质数据库
C、双序列比对工具
D、数据库中搜索相似序列的工具
2、【单选题】关于tBLASTn描述正确的是：
A、是一个核酸数据库
B、是一个为蛋白质序列进行相似性搜索的工具
C、是一个为核酸序列进行相似性搜索的工具
D、其搜索的数据库是蛋白质数据库
E、其搜索的数据库是核酸数据库
F、其搜索的核酸数据库里的核酸序列要先被翻译成6条蛋白质序列
G、要进行相似性搜索的核酸序列需要先被翻译成6条蛋白质序列
3、【单选题】关于tBLASTx描述正确的是：
A、是一个蛋白质数据库
B、是一个核酸数据库
C、是一个为蛋白质序列进行相似性搜索的工具
D、是一个为核酸序列进行相似性搜索的工具
E、其搜索的数据库是蛋白质数据库
F、其搜索的数据库是核酸数据库
G、其搜索的核酸数据库里的核酸序列要先被翻译成6条蛋白质序列
H、要进行相似性搜索的核酸序列需要先被翻译成6条蛋白质序列
4、【单选题】要搜索与某条蛋白质序列相似的并符合某种模式的序列，应该选用的方法是：
A、psi-BLASTn
B、phi-BLASTn
C、psi-BLASTp
D、phi-BLASTp
5、【单选题】要在核酸数据库查询一段与某DNA序列可能编码的蛋白质最相似的序列，应选择：
A、BLASTn
B、BLASTp
C、tBLASTn
D、BLASTx
E、tBLASTx
6、【单选题】两条序列，绝大部分区域都很相似，只是其中一条序列的一个功能区在另一条序列中是缺失的。如果想要通过双序列比对把这个功能区找出来，我们应该怎么设置gap？
A、gap_open大，gap_extend小
B、gap_open小，gap_extend小
C、gap_open小，gap_extend大
D、gap_open大，gap_extend大
7、【单选题】如果你想通过一条蛋白质序列从蛋白质数据库中搜索出一个庞大的蛋白质家族，应该用：
A、psi-blastn
B、phi-blastn
C、psi-blastp
D、phi-blastp
8、【判断题】序列 MGEGGLATA 符合正则表达式 {L}GEx[GAS][LIVM]x(3,7) 。其中{}代表除什么以外，[]代表其中之一，x代表任意字母，(3,7)代表3到7个前面的某字符。
A、正确
B、错误
9、【判断题】序列 FGETAIII 符合正则表达式 {L}GEx[GAS][LIVM]x(3,7) 。其中{}代表除什么以外，[]代表其中之一，x代表任意字母，(3,7)代表3到7个前面的某字符。
A、正确
B、错误
单元作业03
单元测验06
1、【单选题】如果蛋白质三级结构信息已知，用下列那种方法可以提高多序列比对的准确度？
A、TCOFFEE的Expresso
B、TCOFFEE的PSI-Coffee
C、TCOFFEE的TM-Coffee
D、TCOFFEE的M-Coffee
2、【单选题】通过PRINTS数据库查看下面这条蛋白质序列最有可能属于哪一个蛋白质家族？PRINTS：http://www.bioinf.manchester.ac.uk/dbbrowser/PRINTS/seqMKFLSARDFHPVAFLGLMLVTTTAFPTSQVRRGDFTEDTTPNRPVYTTSQVGGLITHVLWEIVEMRKELCNGNSDCMNNDDALAENNLKLPEIQRNDGCYQTGYNQEICLLKISSGLLEYHSYLEYMKNNLKDNKKDKARVLQRDTETLIHIFNQEVKDLHKIVLPTPISNALLTDKLESQKEWLRTKTIQFILKSLEEFLKVTLRSTRQT
A、INTERLEUKIN6
B、RHODOPSIN
C、GLYCHORMONER
D、TRANSFERRIN
3、【多选题】以下哪些工具可以获得序列标识图？
A、WebLogo3
B、MEME
C、JalView
D、Clustal Omega
E、TCOFFEE
F、PRINTS
4、【多选题】以下哪些是多序列比对工具？
A、TCOFFEE
B、Expresso
C、CLUSTAL Omega
D、MUSCLE
E、JSmol
F、WebLogo3
G、Swissprot
5、【多选题】关于JalView描述正确的是？
A、JalView是一个多序列比对编辑工具
B、JalView可以用来做双序列比对
C、JalView可以用来构建系统发生树
D、JalView可以用来预测蛋白质二级结构
E、JalView是一个免费软件
F、Jalview的运行需要JAVA支持
G、JalView只能在线使用，不能安装到本地
H、JalView是一个付费软件
6、【多选题】关于下面这段多序列比对，描述正确的是？<img src="http://edu-image.nosdn.127.net/9AE1FBAB1B1BE289D083E8C5A1679A74.png?imageView
A、第4列是完全保守的一列
B、第3列中的残基有大致相似的分子大小及相同的亲疏水性
C、第1列中的残基一定程度上保留了相似的分子大小及亲疏水性被，但是有替换发生在不相似的残基间
D、第2列是完全不保守的一列
E、第4列中的残基是完全相同的
F、第3列是完全保守的一列
G、第5列中有替换发生在不相似的残基间
H、第2列中的残基都是相同或相似的
单元作业04
单元测验07
1、【单选题】以下哪个不是构建系统发生树的基本算法？
A、最大简约法
B、邻接法
C、最大似然法
D、从头计算法
E、贝叶斯推断法
F、Smith Waterman算法
2、【单选题】在同一物种中的来源于基因复制的同源蛋白属于？
A、直系同源
B、旁系同源
C、异同源
D、分支同源
3、【单选题】来自于不同物种的由垂直家系（物种形成）进化而来的同源蛋白属于？
A、直系同源
B、旁系同源
C、异同源
D、分支同源
4、【单选题】通过基因水平转移，来源于共生或病毒的侵染而产生的同源蛋白属于？
A、直系同源
B、旁系同源
C、异同源
D、分支同源
5、【多选题】按照达尔文进化论学说，下列叙述正确的是？
A、鹿和狼在长期的生存斗争中相互进行选择，结果发展了自己的特征
B、不同岛屿上的加拉帕戈斯地雀因岛上食物不同，都长着独特的喙部
C、食蚁兽的长舌是因长期添食树缝中的蚂蚁反复伸长所致
D、生活在地穴水中的盲螈，因长期不用眼睛而失去视觉
6、【多选题】拉马克提出的法则包括下列哪些？
A、用进废退
B、获得性遗传
C、物竞天择
D、适者生存
7、【多选题】要根据一大组哺乳动物所具有的同源蛋白序列建立系统发生树，可以选择下列哪些物种作为外类群？
A、乌龟
B、蛇
C、大肠杆菌
D、小鼠
E、人
F、猕猴
G、拟南芥
8、【多选题】有4条序列，分别为A:TAGG; B:TACG; C:CGGC; D:AGCC，用UPGMA构建它们的系统发育树，以下哪个是正确的？用序列间不同的碱基数目作为序列间遗传距离的度量。
A、<img src="http://edu-image.nosdn.127.net/2AB3C8CAE4CE45CB2EA70D35215EA12A.png?imageView&thumbnail=890x0&quality=100" />
B、<img src="http://edu-image.nosdn.127.net/0F17D2FE7D03673D79289AB738C49C8F.png?imageView&thumbnail=890x0&quality=100" />
C、<img src="http://edu-image.nosdn.127.net/007C72102780D73321F1A2FD433DEF1C.png?imageView&thumbnail=890x0&quality=100" />
D、<img src="http://edu-image.nosdn.127.net/E4155F4D86973614F101405FDE68A324.png?imageView&thumbnail=890x0&quality=100" />
9、【多选题】为20个物种中的某个特定同源基因做出分子树，发现这20个物种在该树的相对关系与在的生命系统树（物种树）中的相对关系完全不同，这说明以下哪些情况是可能的？
A、基因水平转移
B、受到了特殊环境变化的影响
C、分子树构建错误
D、该基因经历了特殊的演化过程
10、【判断题】相似序列并不一定是同源序列。
A、正确
B、错误
11、【判断题】相似序列一定是同源序列。
A、正确
B、错误
